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10.05.2010

CeGaT: Der Spezialist für DNA- und RNA-Sequenzierungen

Die rasanten technologischen Fortschritte stellen Sequenzier-Dienstleister vor neue Herausforderungen. Was möglich ist, wird am Markt auch verlangt: zuverlässige und schnelle Sequenzanalysen, bei denen selbst ganze Genome im Zeitraum von Tagen bis Wochen bearbeitet werden. Das geht nur mithilfe modernster Hochdurchsatztechnologien. Seit rund einem Jahr bietet die Tübinger CeGaT GmbH DNA- und RNA-Sequenzierungen auf dem neuesten Stand der Technik für alle Bereiche der Life Sciences.

Was „früher“, also ungefähr Anfang dieses Jahrtausends, noch Jahre gedauert hat, ist heute in wenigen Wochen machbar: Das Lesen und Durchsuchen ganzer Genome nach spezifischen Abschnitten, die Hinweise auf bestimmte Erkrankungen geben. „Wir verbinden das Hochdurchsatz-Screening mit der Diagnostik, das ist momentan unser Schwerpunkt. Wir können das heute in einer Dimension anbieten, die es noch nie gab“, sagt Dr. Dr. Saskia Biskup, die Gechäftsführerin der CeGaT GmbH. Sie nennt Zahlen: 30.000 Gene können mithilfe der neuen Geräte gleichzeitig analysiert werden. Das ermöglicht in Rekordgeschwindigkeit die Untersuchung ganzer Exome, also der Gesamtheit aller kodierenden Bereiche der DNA in einem Organismus. „Wir fassen alle Gene, die für eine bestimmte Krankheit bekannt sind, in einem Diagnostik-Panel zusammen und sequenzieren sie parallel. Dadurch wird die Untersuchung nicht nur schneller, sondern auch günstiger“, so Saskia Biskup.

„Das wird eine Revolution in der genetischen Diagnostik auslösen“, ist sich Saskia Biskup sicher. Sie spricht in der Zukunftsform, weil die Entwicklung so neu ist, dass sie noch gar nicht bis zu allen Ärzten durchgedrungen ist, die genetische Analysen benötigen. Die betreuenden Mediziner und ihre Patienten mussten früher manchmal Monate warten, bis bestimmte Testergebnisse vorlagen, das wird sich nun drastisch ändern. Möglich wird das durch die neueste Gerätegeneration, die bei der CeGat GmbH bereits zum Einsatz kommt. CeGaT war das erste Unternehmen am deutschen Markt, das über das SoLiD-Hochdurchsatz-Sequenzier-System von Applied Biosystems verfügte.

CeGaT führt die Revolution in der genetischen Diagnostik an


Dr. Dr. Saskia Biskup und Dr. Dirk Biskup leiten die CeGaT GmbH. Der Firmenname steht für "Center for Genomics and Transcriptomics".  (© Lehmann)

Er ist zurzeit das leistungsfähigste „Arbeitstier", mit dem Gene von Diagnostik-Panels gescreent werden können. „Bei jedem Panel, das wir aufbauen, wird eine Etablierungsphase vorgeschaltet, in der wir alles, was wir mit dem Hochdurchsatz-Gerät finden, in unabhängigen Experimenten mit herkömmlichen Sequenziertechnologien überprüfen", erklärt Dr. Dirk Biskup, der das Unternehmen gemeinsam mit seiner Frau leitet. Die beiden gehen auf Nummer sicher: „Erst wenn wir bei der Sequenzierung von rund hundert Genen in den Kontrollexperimenten 100-prozentige Übereinstimmung finden, geht die Sequenzierung auf dem Hochdurchsatz-Gerät in die Routine", sagt Dirk Biskup.

Nicht bei jedem Panel geht es gleich um hunderte von Genen. Zurzeit konzentriert sich CeGaT auf vier Panels: Epilepsie, Parkinson, Augenkrankheiten und Stoffwechsel-Erkrankungen. „Das Epilepsie-Panel umfasst rund 500 Gene, bei Parkinson sind es ‚nur' etwa 50", sagt Saskia Biskup. Zur Entwicklung der Panels gehört als ein wichtiger Arbeitsschritt die Anreicherung der jeweiligen Gene. Dazu greift CeGaT auch auf externe Kompetenzen zurück und kooperiert mit namhaften Partnern aus Forschung und Industrie. Auch mit Applied Biosystems, dem in den USA ansässigen Lieferanten des Hochdurchsatz-Sequenzierers, arbeitet CeGaT auf der Entwicklungsebene zusammen. „Wir sind Projektpartner im Bereich diagnostischer Anwendungen und in diesem Bereich Hauptansprechpartner für das Unternehmen in Europa", sagt Dirk Biskup.

Prinzipiell ist CeGaT offen für alle Sequenzierprojekte rund um DNA und RNA, aus Tieren und Pflanzen ebenso wie aus Mikroorganismen. „Auch Metagenom-Projekte interessieren uns, es gibt zum Beispiel interessante ernährungsphysiologische Fragestellungen, bei denen Genome diverser Magen-Darm-Bakterien verglichen werden", ergänzt Saskia Biskup. Der Schwerpunkt wird aber wohl die Humangenetik bleiben, nicht zuletzt, weil Saskia Biskup Fachärztin für Humangenetik ist. Neben der Leitung der CeGaT GmbH unterhält sie auch eine eigene Praxis für Humangenetik. Hier werden Patienten und Kunden über alle Aspekte der genetischen Diagnostik informiert, erfahren, wie aussagekräftig die Ergebnisse sind und bekommen Hilfestellungen zu ethischen Fragen.

Gute Basis für eine Firmengründung: Top-Ausbildung und Erfahrung

Die Kunden profitieren von technischer und persönlicher Exzellenz

Für Saskia Biskup war die Entscheidungsfreiheit eine große Motivation zur Firmengründung. „Ich wollte die neuesten Technologien anwenden, zu denen ich an der Universität nicht so ohne weiteres Zugang bekommen hätte. Finanzierungen von teuren Großgeräten sind zwar auch dort möglich, aber das ist in der Regel sehr langatmig und wir hatten Bedenken, dass uns die Konkurrenz aus den USA zuvorkommen könnte, wenn wir zu lange damit warten, uns ein Team und eigene Kompetenzen aufzubauen.“

Das Team aus hochqualifizierten und motivierten Mitarbeiten zusammenzustellen, war gar nicht so einfach. „Es gibt kaum gute Leute auf dem Arbeitsmarkt, die sich mit humangenetischen Fragestellungen auskennen. Das war uns jedoch sehr wichtig, gerade weil wir mit den allerneuesten Methoden arbeiten wollten. Zum Teil haben wir Protokolle bereits angewendet, bevor sie überhaupt für die Allgemeinheit gedruckt wurden“, erzählt Saskia Biskup. Mit Dr. Detlef Böhm konnte die CeGaT GmbH einen der „deutschlandweit besten Experten“ für Sequenzierung, Diagnostik und Datenverarbeitung als gesamtverantwortlichen Laborleiter gewinnen, wie Dirk Biskup betont. „Dr. Böhm hat bereits in der Vergangenheit bewiesen, dass er ein Pionier im Etablieren neuer Methoden für die humangenetische Diagnostik ist. Er ist aufgrund seines Detailwissens und der Breite seines Know-how der ideale Laborleiter für CeGaT“, so Dirk Biskup. Zudem konnte mit Dr. Christian Wilhelm ein Leiter für die humangenetische Diagnostik gewonnen werden, der die klassischen auf dem Markt befindlichen Methoden seit Jahren anwendet und beherrscht.

Das aufwändige Recruiting hat sich gelohnt. Das jetzige Firmenteam umfasst sieben erstklassige Fachleute, auf die sich die Gründer verlassen können – und die mitziehen, wenn es darum geht, Innovationen so schnell wie möglich umzusetzen. Damit stellt das Unternehmen sicher, dass seine Sequenzier-Dienstleistungen in Qualität und Schnelligkeit stets dem höchstmöglichen Standard entsprechen. Die Zertifizierung als humangenetisches Diagnostiklabor steht kurz bevor.
Ein Beitrag von:
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leh - 10.05.2010
© BIOPRO Baden-Württemberg GmbH

Weitere Informationen:
CeGaT GmbH
Dr. Dr. Saskia Biskup
Dr. Dirk Biskup
Paul-Ehrlich-Str. 17
72076 Tübingen
Tel.: 07071 5654400
E-Mail: saskia.biskup(at)cegat.de oder dirk.biskup(at)cegat.de

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